多个样本率作比较的目的在于推断它们各自代表的总体率是否相等。这类资料的基本数据有R行(样本数)2列(阳性数与阴性数)，可称R×2列联表。常用的分析方法为x²检验及对数似然比检验。

x²检验 按式(1)或式(2)计算统计量x²值。

自由度ν=组数-1。(3)式中A为每格的实际频数;T为按检验假设：各总体率相等，均等于合计率时，算出的理论频数;nR、nC分别为某实际频数所在行R、列C的合计;n为各个样本合计的总例数。式(2)直接用实际频数计算，较为简便。

x²检验要求理论频数不宜过小(参见“样本构成比的比较”)，对R×2列联表，R. C. Lewontin和J. Felsen-tein等提出，只要求所有理论频数不小于1，甚至认为多数情况下最小理论频数不小于0.5亦可。

对数似然比检验 用式(4)或式(5)计算统计量G值，G近似于x2分布。如用函数型电子计算器，计算G较x²简捷。

G=2(∑A ln A-∑nR ln nR-∑nC ln nC+nlnn)，(4)

G=4.60517(∑A lg A-∑nR lg nR-∑nC _lg nC+nlgn)，(5)式中A、nR、nc及n的意义同x2检验，v按式(3)计算。

算得统计量x²值(或G值)和ν后，查x²界值表得P值，按所取检验水准作出推断结论。当拒绝检验假设，结论是各总体率不等，只能认为各总体率之间总的来说有差别，但不能说明它们彼此间都有差别，或某两个总体率之间有差别。

例 用免疫酶法观察鼻咽癌患者、头颈部其他恶性肿瘤患者及正常成年人血清中的EB病毒壳抗原的免疫球蛋白A(VCA-IgA)抗体的反应情况，资料见表。三组阳性率有无差别?

H₀：三组阳性率相等，

H₁：三组阳性率不等或不全相等。

α=0.05。

(1) x²检验。按式(2)及式(3)，

三组人群中EB病毒VCA-IgA抗体阳性率

查x²界值表得P<0.005，按α=0.05水准拒绝H₀，接受H₁，说明三组对象的VCA-IgA抗体阳性率有差别。

(2)对数似然比检验。按式(4)及式(3)，

G=2(188 ln 188+10ln 10+…+ 333ln 333-204ln 204

-33ln 33-382ln 382-247ln 247-372ln 372+619ln 619)=387.37，v=3-1=2。

查x²界值表得P<0.005，结论同x²检验。