锰在水中以重碳酸锰[Mn(HCO₃)₂]、硫酸锰(MnSO4)存在，呈悬浑状或胶体状。锰与重碳酸铁共存时可形成锰的重碳酸盐。硫酸锰常存在于含SO42-的酸性水中。氢氧化锰在一般pH值下呈悬浑状，不易氧化。胶体状锰是水中腐植质与锰形成的有机锰。水中锰大都与铁共存。水中有一定量锰存在时，对洗涤淡色衣服有染色作用，易在水管中出现黑色沉淀物(MnO2和MnO的混合物)。当锰的含量大于0.1mg/L时应进行除锰处理。除锰方法与除铁方法基本相仿，常用的有下列几种方法。参见“给水除铁”条。

氧化法： 为使Mn2+易于氧化，可提高水的pH值，使锰氧化物的氧化还原电位降低，以便沉淀而被去除。

(1) 曝气法： 锰的氧化速度较慢，不易沉淀去除，仅在pH>9.8时才能沉淀。在除锰过程中，水内含有Mn2+、等锰和锰化合物，其中Mn₂O₃·2H₂O和MnO₂·H₂O等具有催化作用。当滤床内Mn2O3和MnO2等积聚形成二氧化锰膜，pH值约为8.5时，也有较好的除锰效果。

(2) 加氯氧化法：加氯使锰氧化时，应使水中游离性余氯在0.5～1mg/L左右、并需要MnO₂·H₂O等作催化剂，使氧化作用易于发生。反应过程为

(3) 高锰酸钾氧化法：是一种有效的方法，在中性条件下也能进行氧化反应：

pH值升高，投药量可减少，当原水中含有铁与氨时，应增加高锰酸钾的投加量。一般高锰酸钾投加量为锰含量的2.3～3倍。为防止高锰酸钾影响水色，投药量不宜过多。

(4) 锰砂过滤法：以锰砂作为滤料，氯及高锰酸钾作氧化剂，以保持滤料的氧化能力。此反应在中性或弱酸性条件下进行：

除锰反应主要是借助滤料表面的MnO2进行的，可用MnSO4或MnCl2与高锰酸钾溶液反复处理绿砂、沸石等滤料，增加二氧化锰的被覆量和表面积，提高氧化能力。

(5) 铁细菌除锰，方法与给水除铁相同，但需经过几个月的细菌繁殖过程才能发挥除锰能力。以纤毛菌属的除锰效果较好。

其他方法：锰比铁较难氧化，也可采用离子交换法。但有铁细菌存在或有机物、铁、锰的含量多时，树脂会受到污染，而使交换能力下降。化学沉淀法也用于除锰，可用铝酸钠NaAlO2和氯化铁组成的混合混凝剂，或用石灰、硫酸铝等作混凝剂，加入助凝剂则可提高沉淀效果。