食品工业种类繁多，废水量也较大。污染程度较强的食品工业主要有屠宰场及肉类联合加工厂、乳制品厂和水果蔬菜罐头厂。关于屠宰场及肉类联合加工厂废水处理方法见“屠宰场及肉类联合加工厂废水处理”条。

乳品制造过程中产生的废水，主要含有各种不同浓度的牛乳固体物。来源于腐败的原料(包括乳制品、酪乳、脱脂乳及乳清，溢漏的乳及乳制品)以及洗涤乳桶、设备和地面的废水，冷凝水等。乳品厂废水几乎全部由溶解的有机物或胶悬体组成，悬浮物较少，故处理时不必先经初步沉淀去除悬浮固体和减低生化需氧量。好氧性分解是处理乳品厂废水最合适的方法，其中包括生物滤池和活性污泥法。两级生物滤池可使五日生化需氧量去除90～95%，活性污泥法亦可取得同样的处理效果。

水果、蔬菜、罐头厂废水主要产生于产品的洗涤、漂白、水力传送、设备及地面的清洗等过程，废水中含有大量呈悬浮状态和溶解状态的碳水化合物，其浓度随原料的种类而有很大悬殊。水果、蔬菜、罐头厂废水的处理方法包括化学沉淀、生物滤池、活性污泥法等。化学沉淀法所用的药剂有石灰、明矾、硫酸亚铁等，如投药量合适，可降低悬浮固体的85～90%，生化需氧量的60～75%。生物滤池的处理效果随不同罐头产品而略有不同，生化需氧量一般可降低60～70%。如废水先用化学沉淀法处理，然后再进入生物滤池，还可提高处理效果。在城市污水处理厂不超过负荷的情况下，将罐头厂废水排入其中，用活性污泥法处理，也是一种良好的方法。此外，罐头厂废水还可用于灌溉农田，或利用氧化塘贮存一定时间后排放，但必须特别注意氧化塘的容量，避免超负荷，防止有机物腐败发臭及孳生蚊、蝇等。