植物消毒剂系指药用植物制成的消毒剂，可为煎剂、酊剂或烟熏剂。用于皮肤等活组织表面的植物消毒剂又称植物抗菌剂。用于室内熏蒸消毒的制剂又称植物熏蒸消毒剂。

我国医务工作者曾测定多种植物的抑菌作用，并从中选出一些植物抗菌剂。如15～20%大叶桉 (叶) 煎液、50%紫珠草(叶)煎液、100%𪲻木(叶)煎液、 40%岗稔(根)煎液、10%桉叶油乳液与1%华荠苧油酊剂等对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、炭疽杆菌、乙型溶血性链球菌、白喉杆菌、伤寒杆菌、绿脓杆菌、痢疾杆菌等具较好抑菌作用，经试用外科皮肤消毒，均取得较好效果。20%岗稔根煎液、20%大叶桉叶煎液与75%乙醇对皮肤消毒效果比较，灭除率分别为93.0%、76.9%、92.7%。

植物熏蒸消毒剂多制成熏香或烟雾剂。其主要成分为：①植物药：起杀菌与燃烧作用;②粘合剂，如粘木粉、榆树皮粉等;③助燃剂：如氯酸钾、硝酸钾等;④香料与颜料。以杉木粉为主制成的锯末烟雾剂，用10g/m3，作用60min(18℃)，可杀灭物体表面白色葡萄球菌90%以上。以华荠苧油与杉木粉为主制成的华荠苧油烟雾熏剂，按20g/15m3用量，作用30min，对物体表面的白喉杆菌杀灭率为99.9%，对金黄色葡萄球菌为84.2%。以苍术、艾叶为主制成的苍艾香，用量15g/45m³，点燃2h可使物体表面流感病毒滴度降低5～6个对数级。以苍术、艾叶及无盐食醋为主制成的防感冒醋香，按0.6g/m³用量，点燃60min，可杀灭空气中白色葡萄球菌、金黄色葡萄球菌、卡他奈瑟球菌、甲型溶血性链球菌83～96%。

植物消毒剂可就地取材，制备简易，但杀菌作用较化学消毒剂差，且制剂尚无法标准化，故多仅于无化学消毒剂时使用。