电镜观察比光镜观察较易看到肿瘤细胞的分化特点，因此，对某些在光镜下难于鉴别其来源的肿瘤，特别是转移瘤，电镜观察在判断上有一定的意义。

(1) 癌与肉瘤的区别： 从上皮组织及腺组织来源的恶性肿瘤——癌，有一个共同的特点，即细胞间均可见到联结结构，其中最常见的是桥粒。从柱状上皮及腺上皮来源的癌，还可有中间联结及紧密联结。肉瘤细胞虽常互相紧靠，但一般看不到胞间联结，而常可看到一些胶原纤维等间质(见图)，但也有例外，如滑膜肉瘤、脑膜瘤、间皮瘤及个别软骨肉瘤等。在癌细胞间一般虽可见到胞间联结，但当分化很低时，胞间联结就很难找到，并且发育很差。有些癌细胞变成长梭形，而且分散，在光镜下易被误认为肉瘤，但在电镜下则可以根据癌的分化特点加以鉴别。

纤维肉瘤细胞。细胞略呈长梭形，粗面内质网(ER)丰富，核有畸形，细胞间有胶原纤维(CF)×6400

(2)鳞癌与腺癌的区别： 分化较高的鳞癌与腺癌在光镜下容易鉴别，但在低分化癌，有些鳞癌的细胞可出现腺体样排列，而低分化的腺癌又可呈现弥漫分布，鉴别比较困难。在电镜下，鳞癌的细胞质内总有多少不等的张力原纤维，细胞间的桥粒也比较明显，而腺上皮来源的肿瘤，细胞内泡状系统比较发达，有时可见分泌泡或分泌颗粒，或有微腺腔形成。

(3)肠型胃癌与肠癌的区别： 胃粘膜与肠粘膜的组织结构有明显差别，因此不难区分。但在胃癌中，大多数病例有肠型化生，与肠癌十分类似，二者均可有肠型微绒毛，即在微绒毛中心有细丝组成的轴心，并有类似肠腺中杯状细胞的粘液分泌泡。但以下两点在鉴别上有一定意义： ①在胃癌细胞中，常有细胞内微囊出现，而在肠癌细胞中极难见到;②在肠型胃癌中有时尚可保留一部分胃型上皮的特点。如胃型粘液分泌泡中，有一电子密度大的核样体，此外可见细胞表面有胃型微绒毛。

(4) 内分泌腺肿瘤与一般腺上皮肿瘤的区别： 二者的粗面内质网都比较发达，但内分泌腺肿瘤细胞的粗面内质网有一定特点，即常呈短小多层平行排列的内质网，而其他腺上皮肿瘤的粗面内质网常分散排列，或较长。此外，在内分泌腺肿瘤中，可见到电子密度大的分泌颗粒，在颗粒外有质膜包绕。

(5) 恶性软组织肿瘤的区别： 恶性软组织肿瘤中，恶性纤维性组织细胞瘤、多形性脂肪肉瘤及多形性横纹肌肉瘤，有时在光镜下不易区分，用电镜观察有助于鉴别。在恶性纤维性组织细胞瘤中有中等粗的微丝(100)，多分布于核周，脂质仅限于黄色瘤细胞中;多形性脂肪肉瘤的成脂细胞中可见较多的脂质，溶酶体也显著;在多形性横纹肌肉瘤中，可见细微丝及粗微丝(75及220)，有时可见肌节，糖元丰富。

(6)星形胶质细胞瘤与室管膜瘤的区别： 在室管膜下的星形胶质细胞瘤，与室管膜瘤有时在光镜下不易区分，电镜下，根据分化程度及异型性大小，可将星形细胞瘤分为四级。级别低者，瘤细胞类似正常星形细胞，细胞的大小与形状比较规则，排列疏松，细胞内有多少不等的胶质纤维;级别高者，细胞排列较密，异型性显著，常有多核巨细胞出现，细胞内极少胶质纤维，微管与核蛋白体较多。在室管膜下的星形胶质细胞瘤中，常混有少量室管膜细胞。室管膜瘤细胞多数呈多边形或梭形;分化低者，细胞内核蛋白体较多，其他细胞器少;分化较高者，细胞内可见较丰富的粗面内质网、线粒体与微管等。瘤细胞有时呈菊花样排列，细胞间可见中间或紧密联结。在少数细胞内或其表面可见纤毛。在室管膜瘤中，也可混有少量星形细胞。

(7) 无色素性黑色素瘤与未分化癌的区别： 有的黑色素瘤，在光镜下不易看到色素，很难与未分化癌区别;而在电镜下观察，此种细胞内可见到黑色素前体颗粒。