荚膜组织胞浆菌为双相型真菌。在宿主网状内皮细胞和周围血细胞内呈酵母菌型(图1)，以发芽方式繁殖; 在葡萄糖琼脂培养基上(37℃下孵育)或在条件合适的土壤中为霉菌型。患者的血液、骨髓、痰、粘膜溃疡、脾或淋巴结穿刺液涂片，用 Giemsa染色可在细胞内见许多象利什曼原虫的卵圆形小体，直径1～ 5μm，中央浓染，周围有荚膜样不染色环，但并非荚膜。在沙氏(Sabouraud)葡萄糖琼脂培养基上室温培养10天左右开始生长。菌落初为圆形、表面有较大的皱折，气生菌丝初为白色棉花样，后变为淡黄色以至棕色。镜检可见菌丝中间有横隔和分枝。在菌丝顶端或侧枝上有2.5～3.0μm的圆形小分生孢子，具有较强的感染性。在陈旧的培基上生长1～2月后，形成直径8～20μm的厚壁大分生孢子(图2)，其表面有棘突似齿轮，是诊断的重要形态学依据。

图1 小鼠肝脏巨噬细胞中的酵母型荚膜组织胞浆菌

图2 荚膜组织胞浆菌的大分子孢子

1972年Kwon-Chung发现本菌具有两性生殖期，在一定条件下，不同菌株的两种菌丝先缠在一起，以后逐渐形成80～250μm的闭囊壳，其中含有许多子囊果，每个子囊果中含有8个透明而光滑的子囊孢子。这种子囊孢子有雌雄两性，结合后产生典型的分生孢子。本菌的有性繁殖期称为荚膜埃莫菌。

本菌酵母型和霉素型都能致病。实验动物中小鼠最敏感，1～10个孢子滴鼻或腹腔注射即能感染。大动物中狗最敏感。从土壤中分离本菌，应用小鼠腹腔注射法，可获得较高的阳性率。孢子在干燥土壤中能存活4年，在4℃河水中能存活621天，在37℃水中能存活62天，在1～2‰福尔马林中经24小时方能灭活。

荚膜组织胞浆菌易于大量生产，孢子对干燥、温度及化学消毒剂抵抗力较强。人对本菌易感，患病后失能期长，住院期常超过6个月。常发生实验室感染。目前尚无实用的菌苗。根据上述特点，美国深入研究本病的M. L.Furcolow认为本菌是比较理想的失能性生物战剂。