隔离是使处于传染期的病人或病原携带者尽量减少与他人接触的机会，并合理地实施消毒和卫生措施，以防止传染病传播的措施。隔离是使传染源无害化的重要手段。

传染病的隔离方式，视具体条件分为传染病院或综合医院传染病科住院隔离、临时传染病病室隔离和家庭隔离等。①住院隔离： 病人住院隔离是最合理、最有效的方式。无论传染病院或综合医院的传染病科，对病人入院时的诊察、卫生处理、运送工具的消毒、探病、陪侍病人、病人排泄物和分泌物的随时消毒、住院时的活动、出院条件、尸体处理、出院后的随访等，均有完善的规章制度。传染病院和综合医院的传染病科，在建筑设计上应充分考虑便于隔离和消毒的要求，包括单独隔离室、观察室、消毒设施、卫生处理间和污水的无害化装置等。②临时病室隔离：当发生较多的细菌性痢疾、流行性感冒、病毒性肝炎、麻疹等传染病人时，由于病人突然增多，不能保证全部病人均收入传染病院或综合医院传染病科隔离治疗，这时可在居民点、机关单位、人民公社、学校或营房中选择便于与其他成员隔绝的房屋，并组织专人筹措临时隔离病室，以收容那些应当隔离的病人，进行集中管理和治疗，减少病原体的传播，以阻断流行。③家庭隔离：对乙类传染病中的某些疾病，例如百日咳、麻疹、痢疾等，如果病情不重，又无其他合并症者，可以采取家庭隔离的方式。在家庭隔离期间卫生防疫人员必须按要求定期访视，指导病人及其家属执行隔离和消毒等措施。例如对痢疾病人实施床边隔离，即病人固定床位，作好随时消毒，减少对周围人的影响。

有些症状较轻的消化道传染病病人或病原携带者则实行生活隔离，即食具专用，粪便、衣物消毒，对他们进行宣传教育，使他们能自觉地遵守卫生制度，以避免传播。有些呼吸系统传染病(如麻疹)的病人可以在家中居室的一角设床休养，周围挂帷帐。兵营、集体宿舍在呼吸道传染病流行期间把床位间距离加大到2m以上，就寝时头位交错，也是一种空气隔离的办法。

各种传染病的隔离期限，原则上均按照各种传染病病人传染期限而定。根据条件还可以配合实验室检验结果来决定其是否可以解除隔离。

白喉、伤寒、霍乱等在临床症状消失后进行2～3次病原学检验，检验结果阴性者，可解除隔离。如为斑疹伤寒，则于退热后1～2天在保证彻底灭虱的情况下，即可解除隔离。另外，如转为慢性或迁延过程的病人以及慢性病原携带状态者(细菌性痢疾、伤寒、乙型肝炎等)，常常不能待传染性完全消失后才解除隔离，这时应在病人出院后通知卫生防疫机构严格登记，对他们进行观察、指导，并定期进行病原学检查。如病人本身是特殊职业者(如托幼机构或饮食业人员)，应动员在一定期限内调换职业，以防传染健康人。

隔离措施的对象和效果因病种不同而异。有些传染病，如天花、肺鼠疫、麻风、麻疹等，因病人是唯一的传染源，隔离的效果显著。在疫源地内如能迅速全部隔离病人，在整个预防或防疫措施中必将起到重要的作用。例如在肺鼠疫区，如确实能把所有的肺鼠疫病人隔离，则在6～10天内即可控制肺鼠疫流行。另一些疾病，如森林脑炎、恙虫病、流行性乙型脑炎、布鲁菌病、血吸虫病等，病人在人群间不起传染源作用或作为传染源的意义不大，因此，不需要隔离。还有一些传染病，如脊髓灰质炎、流行性脑脊髓膜炎等，由于存在大量轻型、非典型、逍遥型或病原携带者，所以不专门依靠隔离来控制流行。

隔离的作用在疾病的不同临床阶段亦有所不同。对重症痢疾、伤寒、斑疹伤寒、猩红热等的病人，进行隔离治疗极为重要。因为这些病人的排菌量极大。同时也必须认识到多数传染病单靠隔离还不能达到完全控制或消灭传染病的目的，因为有许多轻型病人及病原携带者，由于他们可以自由活动，反而比已隔离的病人起更重要的传染源作用。