医院病例集中，各种医疗处理过程用水使医院污水中可含大量病原体，如伤寒杆菌、痢疾杆菌、霍乱弧菌、结核杆菌、致病原虫、肠道病毒、腺病毒、呼肠孤病毒、传染性肝炎病毒、血吸虫卵、钩虫卵等，并有医疗诊断、消毒处理等的废弃物，如血、痰、药物、放射性废物等，如处理不当，污染环境时，可对居民健康发生严重危害。

医院污水包括病人生活污水和医疗废水两大部分。污水的产量，因医院供水及设备管理等不同，相差很大，以每天每一病床平均约为1000L计，则100～500张床位的医院，日排放污水为100～500t。

医院污水污染的主要危害是引起肠道传染病，其次为结核病的传播。据调查，一般传染病房的污水中可含肠道病菌10³～10⁶个/L，病毒10⁵个单位/L及蠕虫卵10～15个/L，甚至100个/L。结核病院污水中所含结核杆菌更多，可达106～109个/L。这些病原体在外界环境中可生存数月以上。因此医院污水污染水体或土壤后，能在较长时间中通过饮水或食物传播疾病。水体中贝类有浓缩病菌和病毒的能力，生食贝类的危险性更大。含有结核杆菌污水的排放口下游有露天游泳场时，可导致游泳者的结核菌直接感染。

医院内设有同位素诊治部门时，因污水中可有放射性1³¹I、³²P_、2⁴Na等，如污染环境，可引起居民的内外放射性照射的危害。

为了防治医院污水污染，要求新建、扩建及改建各类医院时设置污水净化、消毒设备，而原有医院应根据污水的危害程度，限期采取必要的污水处理措施。医院污水排出口，不得设在当地公用水水源及露天游泳场的上游。

新建综合医院的传染病区与普通病区的污水可实行分流，再分别进行净化、消毒。职工生活区与行政区污水可排入城市下水道内。污水消毒一般采用加氯法，但必须根据污水中所含肠道病原菌、结核杆菌和病毒的不同，要求不同的加氯接触时间和余氯量(见“医院污水排放标准”条)以达到消毒效果。

污水净化后，水质应符合污水排放标准和符合地面水水质卫生标准的要求，含放射性物质的污水并应符合放射防护的规定。